Univ.-Prof. Dr. med. Bernhard Baune studierte Humanmedizin an der Universität Münster bis 1996 und begann seine Weiterbildung zum Facharzt für Psychiatrie und Psychotherapie 1997. Im selben Jahr erfolgte die Promotion. Er schloss berufsbegleitende Studiengänge der Gesundheitswissenschaften (MPH - Master of Public Health) an der Universität Bielefeld im Jahr 2001 und den Master of Business Administration (MBA - Health) an der Universität Wismar im Jahr 2019 erfolgreich ab. Im Jahr 2009 erhielt er die Venia Legendi für das Fach der Psychiatrie und Psychotherapie. Seit 2009 ist Prof. Baune Fellow des Royal Australian and New Zealand College of Psychiatrists (FRANZCP).
Im Februar 2002 schloss er seine Weiterbildung zum Facharzt für Psychiatrie und Psychotherapie ab und erwarb außerdem die Fachkunde Suchtmedizin. Im selben Jahr übernahm Prof. Baune die Leitung eines Integrierten Mental Health Service an der St. Georges Medical School, London, und war Lecturer an der University of London. Im Jahr 2004 wurde er zum Oberarzt an der Klinik für Psychiatrie und Psychotherapie des Universitätsklinikums Münster ernannt.
Wissenschaftlich beschäftigt sich Prof. Baune mit den molekularen und immunologischen Grundlagen psychischer Erkrankungen sowie mit der Neurobiologie der Therapieantwort auf medikamentöse, neurostimulatorische und psychotherapeutische Interventionen. Er kooperiert in zahlreichen internationalen Konsortien und gründete und leitet ein europäisches Netzwerk zur klinisch-neurobiologischen Prädiktion der psychopharmakologischen Therapieantwort bei schweren psychischen Störungen. Das von ihm gegründete weltweite Konsortium zur Genomik der EKT Therapieantwort steht ebenfalls unter seiner Leitung. Seine >530 wissenschaftlichen peer-reviewten Publikationen enthalten Veröffentlichungen in erstklassigen Journalen der Fachgebiete der Psychiatrie und Neurowissenschaften sowie in allgemeinwissenschaftlichen Zeitschriften wie Lancet, Nature, Science und The New England Journal of Medicine.
Im Jahr 2006 wurde er zum Professor für Psychiatrie an der James Cook University, Townsville, Australia, ernannt. Den Lehrstuhl für Psychiatrie und die Leitung der Psychiatrie an derselben Universität übernahm Prof. Baune von 2008 bis 2010, bevor er Anfang 2011 zum Professor und Direktor der Psychiatrie an der University of Adelaide, Australia, berufen wurde. Im April 2018 trat er den Ruf auf den Lehrstuhl für Psychiatrie und den Cato Chair an der University of Melbourne, Melbourne Australia, an. Seit März 2019 ist Herr Univ.-Prof. Bernhard Baune Klinikdirektor der Klinik für Psychische Gesundheit des Universitätsklinikums Münster.