Hirntumoren setzen sich aus unterschiedlichen Bausteinen (Zellen) zusammen. Diese heterogenen Zellpopulationen umfassen auf der einen Seite unterschiedliche Tumorzellpopulationen und Zellen der Tumormikroumgebung (TME). Zellen der Tumormikroumgebung sind beispielsweise Zellen des Immunsystems und infiltrierende Zellen des zentralen Nervensystems. Verschiedene Tumorzellpopulationen haben unterschiedliche Eigenschaften beispielsweise in Hinblick auf Zellproliferation, Metastasierung und den Zellmetabolismus. Eine hohe Heterogenität von Tumorzellen ermöglicht potenziell eine dynamische Adaptation des Tumors beispielsweise während einer Therapie und ist damit potenziell in die Entstehung von Therapieresistenzen involviert.  Tumorzellen und Zellen der TME kommunizieren miteinander und beeinflussen somit gegenseitig die jeweils ihre Eigenschaften.

In diesem Projekt untersuchen wir die Tumorzellheterogenität von Hirntumoren des Kindes- und Jugendalters durch die Verwendung von Einzelzell-RNA- Sequenzierungen (10X Plattform; www.10xgenomics.com) und Multiplex-Färbungen. Wir untersuchen entsprechende Tumorproben dazu bei der Primärdiagnose und im weiteren Therapieverlauf (z. B. bei erneuter Operation unter Chemotherapie oder während eines Rezidives), um Adaptationsmechanismen des Tumors zu evaluieren.

Benötigtes Material
Einzelzell-RNA-Sequenzierungen führen wir an „frischem“ Tumormaterial durch (dieses Material darf nicht fixiert und nicht eingefroren sein). Wir benötigen für entsprechende scRNA Seq möglichst viel Tumormaterial (mindestens aber in einer Größe von 1mm x 1mm x 1mm). Für die Organisation des Materialtransports und für entsprechende Kosten kommt die AG Kerl auf.

Kontaktadresse
PD Dr. Kornelius Kerl
Email: kornelius.kerl(at)­ukmuenster(dot)­de
Tel.: 0251-83 47742 oder 0251-83 43416
Fax.: 0251-83 47941