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AG Wethmar – Translationale Regulation der Genexpression
Upstream open reading frames (uORFs) sind regulatorische Sequenzelemente der 5´-untranslatierten mRNA-Region und kommen in fast allen humanen Transkripten vor. Viele uORFs steuern die Translation des nachgelagert kodierten Hauptproteins in Abhängigkeit unterschiedlicher extra- und intrazellulärer Signale. Außerdem kodieren einige uORFs selbst für Proteine (uPeptide), die wichtige zelluläre Funktionen steuern.
Mechanismen der uORF-vermittelten translationalen Expressionskontrolle
Die folgende Abbildung illustriert verschiedene Mechanismen der uORF-vermittelten Regulation anhand mehrerer mRNA-Modelle mit 5´-cap-Struktur (schwarze Punkte), 5´-untranslatierter Region (schwarze Striche), vorgelagerten uORFs (orange) sowie der kodierenden Sequenz des Hauptproteins (CDS, blau). GCN4 = amino acid starvation-responsive transcription factor GCN4.
(Abb. nach Wethmar 2014, WIRES RNA)
Unsere Forschung
Unsere Arbeitsgruppe untersucht die funktionelle Bedeutung uORF-assoziierter Mutationen und die Rolle der uPeptide bei der Krebsentstehung. Ziel unserer Forschung ist es, uORFs und uPeptide für gezielte (immun-)therapeutische Interventionen nutzbar zu machen.
Kontakt/Teamleitung
Priv.-Doz. Dr. med. Dr. rer. nat. Klaus Wethmar
Facharzt für Innere Medizin, Hämatologie und Onkologie
Oberarzt der Medizinischen Klinik A, Abteilung für Hämatologie, Hämostaseologie, Onkologie und Pneumologie
Kontakt
Unser Team
Dr. med. Lina Kolloch
Assistenzärztin
Dr. rer. nat. Lara Jürgens
Laborkoordinatorin
- The Emerging Role of uORF-Encoded uPeptides and HLA uLigands in Cellular and Tumor Biology. (Jürgens L, Wethmar K.)
- The new uORFdb: integrating literature, sequence, and variation data in a central hub for uORF research. (Manske F, Ogoniak L, Jürgens L, Grundmann N, Makałowski W, Wethmar K.)
- Upstream open reading frames regulate translation of cancer-associated transcripts and encode HLA-presented immunogenic tumor antigens. (Nelde A, Flötotto L, Jürgens L, Szymik L, Hubert E, Bauer J, Schliemann C, Kessler T, Lenz G, Rammensee HG, Walz JS, Wethmar K)
- Somatic Functional Deletions of Upstream Open Reading Frame-Associated Initiation and Termination Codons in Human Cancer. (Jürgens L, Manske F, Hubert E, Kischka T, Flötotto L, Klaas O, Shabardina V, Schliemann C, Makalowski W, Wethmar K)
- Loss-of-function uORF mutations in human malignancies. (Schulz J, Mah N, Neuenschwander M, Kischka T, Ratei R, Schlag PM, Castaños-Vélez E, Fichtner I, Tunn PU, Denkert C, Klaas O, Berdel WE, von Kries JP, Makalowski W, Andrade-Navarro MA, Leutz A, Wethmar K)
- Comprehensive translational control of tyrosine kinase expression by upstream open reading frames. (Wethmar K, Schulz J, Muro EM, Talyan S, Andrade-Navarro MA, Leutz A)
- The regulatory potential of upstream open reading frames in eukaryotic gene expression. (Wethmar K)
Medizinische Klinik A (Hämatologie, Hämostaseologie, Onkologie und Pneumologie)
Albert-Schweitzer-Campus 1
Gebäude A1
48149 Münster
